RESUMO Objetivou-se, com este trabalho, estimar parâmetros genéticos para características do crescimento de animais da raça Nelore Mocho. Foram utilizados pesos corporais (Kg) ajustados aos 205 (P205), 365 (P365) e 550 (P550) dias. Adotou-se modelo multicaraterísticas ajustado para o efeito fixo dos grupos de contemporâneos, idade da vaca ao parto (covariável) e, para os efeitos aleatórios genético direto, genético materno, ambiente permanente materno e residual. As variâncias genéticas diretas (98,80, 276,38 e 547,52 Kg2) e maternas (61,77, 64,63 e 79,85 Kg2), elevaram-se com o avanço das idades. Observou-se redução das variâncias de ambiente permanente materno de P205 para P365 e aumento para P550. As herdabilidades diretas, e seus erros padrão, para P205, P365 e P550 foram respectivamente de 0,21 ± 0,01; 0,38 ± 0,00 e 0,39 ± 0,00. As herdabilidades maternas foram maiores no início da vida dos animais (0,13 ± 0,01, 0,08 ± 0,00 e 0,05 ± 0,00). As correlações genéticas diretas foram superiores a 0,94. As correlações fenotípicas apresentaram valores de moderados a altos (0,50 a 0,87). As correlações genéticas maternas e de ambiente permanente materno foram superiores a 0,91. Ganhos genéticos são esperados, ao se usarem as características do crescimento como critérios de seleção. A existência de variabilidade genética permite a seleção em idades menores, possibilitando a redução do intervalo de gerações e aumento do ganho genético.

ABSTRACT We aimed to estimate genetic parameters for growth traits of Polled Nellore beef cattle. Adjusted weights at 205 (W205), 365 (W365) and 450 (W450) days were used. The effects of contemporary groups (fixed), dam age at calving (covariate), and additive genetic, maternal genetic, maternal permanent environmental and residual (random) were fit under a multi-trait model. The additive genetic (98.80, 276.38 and 547.52 Kg2) and maternal genetic (61.77, 64.63 and 79.85 Kg2) variances estimates increased as the age of the animals increased. Unlikely, a decrease was observed from W205 to W365 for the maternal permanent environmental effect. Direct heritability estimates were, respectively, 0.21 ± 0.01; 0.38 ± 0.00 and 0.39 ± 0.00 for W205, W365 and W450. The maternal heritabilities were higher in lower ages (0.13 ± 0.01, 0.08 ± 0.00 and 0.05 ± 0.00). Genetic correlations were higher than 0.94 whereas phenotypic were between 0.50 and 0.87. Maternal correlations were higher than 0.91 for genetic and permanent environmental effects. Potential genetic gain might be expected by using any of these growth traits as selection criterion. The verified genetic variability may allow the selection of animals in lower ages (e.g., weaning), enabling higher genetic gain and generation interval reduction.

Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar o uso da regressão quantílica regularizada (RQR) para predição do mérito genético em suínos quanto a características assimétricas de carcaça, em comparação ao método do lasso bayesiano (Blasso). Foram utilizados dados genéticos das características rendimento de carcaça, espessura de bacon e espessura de toucinho de uma população F2 composta por 345 indivíduos, obtida pelo cruzamento de animais da raça Piau com os de raça comercial. A RQR foi avaliada tendo-se considerado diferentes quantis (τ = 0,05 a 0,95). O modelo de RQR utilizado para estimar o mérito genético apresentou acurácias maiores ou iguais àquelas obtidas pelo Blasso, para todas as características estudadas. Houve incremento de 6,7 e 20,0% na acurácia, quando se consideraram os quantis 0,15 e 0,45 na avaliação do rendimento de carcaça e da espessura de bacon, respectivamente. Os resultados obtidos são indicativos de que a regressão quantílica regularizada apresenta maior acurácia que o método lasso Bayesiano para predição do mérito genético de variáveis assimétricas de carcaça.

Abstract: The objective of this work was to evaluate the use of regularized quantile regression (RQR) to predict the genetic merit of pigs for asymmetric carcass traits, compared with the Bayesian lasso (Blasso) method. The genetic data of the traits carcass yield, bacon thickness, and backfat thickness from a F2 population composed of 345 individuals, generated by crossing animals from the Piau breed with those of a commercial breed, were used. RQR was evaluated considering different quantiles (τ = 0.05 to 0.95). The RQR model used to estimate the genetic merit showed accuracies higher than or equal to those obtained by Blasso, for all studies traits. There was an increase of 6.7 and 20.0% in accuracy when the quantiles 0.15 and 0.45 were considered in the evaluation of carcass yield and bacon thickness, respectively. The obtained results are indicative that the regularized quantile regression presents higher accuracy than the Bayesian lasso method for the prediction of the genetic merit of pigs for asymmetric carcass variables.

Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar os critérios para formação de grupos de contemporâneos (GCs) na avaliação genética de peso ao desmame em bovinos Nelore. Foram utilizados 713.474 registros de 3.066 rebanhos localizados no Centro-Oeste e no Norte do Brasil. Os dados foram provenientes do Serviço de Registro Genealógico das Raças Zebuínas da Associação Brasileira dos Criadores de Zebu. As estruturas de dados foram definidas com base no número de desvios-padrão (DPs) para remoção de outliers (±2,0, ±2,5, ±3,0 e ±3,5) e no número mínimo de animais por GC (3, 7 e 15). A avaliação genética foi realizada por meio de modelo animal via inferência bayesiana. As estruturas de dados com ±3,5 DPs e GC com mínimo de 15 animais apresentaram a maior variância genética aditiva (82,65±2,93), e aquelas com ±2,0 DPs e GC com mínimo de 3 animais, a menor (60,23±1,96). A formação correta de GCs resulta em arquivos de dados mais consistentes, o que permite obter estimativas mais confiáveis dos parâmetros genéticos. As melhores respostas à seleção são obtidas ao se adotar os seguintes critérios para remoção de outliers: 2,5, 3,0 e 3,5 desvios-padrão e mínimo de 15 animais por grupo de contemporâneos.

Abstract: The objective of this work was to evaluate the criteria for the formation of contemporary groups (CGs) in the genetic evaluation of body weight at weaning in Nellore cattle. A total of 713,474 records from 3,066 herds located in Midwestern and Northern Brazil were used. Data were obtained from the genealogical registry of zebu breeds of the Brazilian association of zebu breeders. Data structures were defined based on the number of standard deviations (SDs) for outlier removal (±2.0, ±2.5, ±3.0, and ±3.5) and on the minimal number of animals per CG (3, 7, and 15). Genetic evaluation was performed with an animal model using Bayesian inference. Data structures with ±3.5 SDs and CG with at least 15 animals presented the highest additive genetic variance (82.65±2.93), and those with ±2.0 SDs and CG with at least 3 animals showed the lowest one (60.23±1.96). The proper formation of CGs results in better-quality data archives, allowing to obtain more trustable estimates for the genetic parameters. Better selection responses are obtained when the following criteria are adopted for the removal of outliers: 2.5, 3.0, and 3.5 standard deviations and a minimum of 15 animals per contemporary group.

RESUMO: Objetivou-se estudar a efetividade da redução da dimensão da matriz de covariância do efeito genético direto na avaliação genética do crescimento (pesos dos 100 aos 730 dias de idade) de bovinos Simental, por meio da análise de componentes principais, e estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos. A análise de componentes principais foi realizada ajsutando-se cinco diferentes modelos: um modelo multicaracterístico padrão, de posto completo, e quatro modelos de posto reduzido. Os modelos foram comparados via informação de Akaike (AIC) e informação Bayesiana de Schwarz (BIC). Os componentes de variância e parâmetros genéticos foram obtidos via REML. Os valores de AIC e BIC para os modelos testados foram similares, indicando a possibilidade da escolha de um modelo mais parcimonioso na avaliação genética da raça Simental. O primeiro componente principal explicou mais de 96% de toda variação genética aditiva direta em ambos os modelos. Os valores de herdabilidades foram maiores em idades mais avançadas e variaram de 0,05 (peso aos 100 dias) a 0,30 (peso aos 730 dias). As estimativas de correlações genéticas foram similares em todos os modelos e apresentaram mesma magnitude e comportamento independentemente do número de componentes principais adotado. Diante dos resultados, pode-se afirmar que apenas o primeiro componente principal foi suficiente para explicar quase que na totalidade a variação genética aditiva direta existente. Além disso, a similaridade dos parâmetros genéticos estimados e a menor demanda computacional são indicativos da possibilidade da utilização de modelos mais parcimoniosos na avaliação genética de bovinos Simental.

ABSTRACT: The aim of this research was to evaluate the dimensional reduction of additive direct genetic covariance matrices in genetic evaluations of growth traits (range 100-730 days) in Simmental cattle using principal components, as well as to estimate (co)variance components and genetic parameters. Principal component analyses were conducted for five different models-one full and four reduced-rank models. Models were compared using Akaike information (AIC) and Bayesian information (BIC) criteria. Variance components and genetic parameters were estimated by restricted maximum likelihood (REML). The AIC and BIC values were similar among models. This indicated that parsimonious models could be used in genetic evaluations in Simmental cattle. The first principal component explained more than 96% of total variance in both models. Heritability estimates were higher for advanced ages and varied from 0.05 (100 days) to 0.30 (730 days). Genetic correlation estimates were similar in both models regardless of magnitude and number of principal components. The first principal component was sufficient to explain almost all genetic variance. Furthermore, genetic parameter similarities and lower computational requirements allowed for parsimonious models in genetic evaluations of growth traits in Simmental cattle.

The weight records from Simmental beef cattle were used in a genetic evaluation of growth with or without the inclusion of animals obtained by embryo transfer. A multi-trait model in which embryo transfer individuals were excluded (MTM1) contained 29,510 records from 10,659 animals, while another model without exclusion of these animals (MTM2) contained 62,895 weight records from 23,160 animals. The weight records were adjusted for ages of 100, 205, 365, 450, 550 and 730 days. The (co)variance components and genetic parameters were estimated by the restricted maximum likelihood method. The (co)variance components were similar in both models, except for maternal permanent environment variance. Direct heritabilities (h²d) in MTM1 were 0.04, 0.11, 0.20, 0.27, 0.31 and 0.42, while in MTM2 they were 0.11, 0.11, 0.17, 0.21, 0.22 and 0.26 for 100, 205, 365, 450, 550 and 730 days of age, respectively. Estimates of h²d in MTM1 were higher than in MTM2 for the weight at 365 days of age. Genetic correlations between weights in both models ranged from moderate to high, suggesting that these traits may be determined mainly by the same genes. Animals from embryo transfer may be included in the genetic evaluation of Simmental beef cattle in Brazil; this inclusion may provide potential gains in accuracy and genetic gains by reducing the interval between generations.